Restricción histórica análisis genómico

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Restricción histórica análisis genómico (o RLGS) es una genoma método de análisis que permite la rápida visualización simultánea de miles de lugares de interés, o sitios de restricción. Usando una combinación de enzimas de restricción algunos de los cuales son específicos de Modificaciones de ADN, la técnica puede utilizarse para visualizar las diferencias en metilación los niveles a través de la genoma de un organismo dado.[1] RLGS emplea etiquetado directo de DNA, que es el primer cortado por una serie específica de enzimas de restricción y luego marcado por un radiactivo Isótopo (generalmente fósforo-32). A dos dimensiones electroforesis proceso es entonces empleada, dando resultados de alta resolución. El gel de segunda dimensión radiactivo entonces se permite exponer una hoja grande de película. La radiación producida por el etiquetado radiactivo provocará la película estar expuestos siempre que los fragmentos de restricción han emigrado durante la electroforesis. Luego se desarrolla la película, produciendo una representación visual de los resultados en forma de un autoradiograph. La misma combinación de enzimas de restricción produce el mismo patrón de 'spots' de muestras de los organismos de la mismas, pero diferentes patrones para diferentes tipos de organismo. Por ejemplo, humano y ratón ADN producirán distintamente diversos patrones cuando se tratan con la misma combinación de enzimas. Estas acabados auto-rads pueden ser examinados, revelan los cambios en la expresión génica que conducen a diferencias visuales en la película. Cada autoradiograph contiene miles de puntos, cada uno correspondiente a una señal de restricción de ADN marcada.

RLGS se convierte en muy útil cuando se hace todo el genoma analiza y efectivamente puede hacer el trabajo de miles de reacciones en cadena de polimerasa a la vez. Detecta fácilmente alteraciones de la desviación de la normal y es extraordinariamente eficaz en la identificación de hiper/hipometilación en tumores, eliminaciones o amplificaciones de genes, o simplemente cambios en la expresión del gen durante el desarrollo de un organismo.

Fuentes

  • Método de análisis genómico del hito de restricción y sus diversas aplicaciones.. Electroforesis 14 (4): 251 – 8. Abril de 1993. PMID8388788.
  • https://www.informatics.Jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:71287
  • una foto de un auto-rad del Roswell Park Cancer Institute

Referencias

  1. ^ Costello, JF; Joseph F. Costello, Christoph Plass, Webster K. Cavenee (2002-03-01). "Genoma de restricción histórica exploración". Métodos en Biología Molecular 200:: 53-70. doi:10.1385/1-59259-182-5:053. ISBN1-59259-182-5. PMID11951655. 2009-01-30.


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