World Community Grid

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World Community Grid
World Community Grid.PNG
Desarrollador (s) IBM
Versión inicial 16 de noviembre de 2004(2004-11-16)[1]
Versión estable World Community Grid: 7.2.47
Estado de desarrollo Activo
Sistema operativo Microsoft Windows, Linux, Android, Mac OS X, FreeBSD
Plataforma BOINC
Tipo Voluntarios de computación
Rendimiento promedio 479.769 TFLOPS[2]
Usuarios activos 73.397 (julio de 2014)[2]
Total de usuarios 461.483[2]
Anfitriones activos 269.840 [2]
Anfitriones totales 2.259.641[2]
Sitio web worldcommunitygrid.org

World Community Grid (WCG) es un esfuerzo para crear público más grande del mundo Computación grid para hacer frente a proyectos de investigación científica que benefician a la humanidad.[3] Lanzado el 16 de noviembre de 2004, es coordinado por IBM con el software de cliente disponible actualmente para Windows, Linux, Mac OS X, y FreeBSD sistemas operativos.[4][5][6]

Usando el tiempo de inactividad de computadoras alrededor del mundo, proyectos de investigación del World Community Grid han analizado aspectos de la genoma humano, VIH, dengue, distrofia muscular, cáncer, gripe, los cultivos de arroz, y energías limpias.. A partir de abril de 2014, la organización se ha asociado con 463 otras compañías y organizaciones para ayudar en su trabajo y tiene más de 73.000 usuarios registrados activos.[2][7]

Contenido

  • 1 Historia
    • 1.1 Escala del proyecto
  • 2 Operación
    • 2.1 Problemas potenciales
  • 3 Las estadísticas y la competencia
  • 4 Extensión
  • 5 Proyectos activos
    • 5.1 FightAIDS@Home
    • 5.2 Ayudar a cáncer infantil de lucha
    • 5.3 El proyecto de energía limpia – fase 2
    • 5.4 Decir No a Schistosoma
    • 5.5 Mapeo de marcadores de cáncer
  • 6 Proyectos finalizados
    • 6.1 Plegamiento del proteoma humano – fase 1
    • 6.2 Ayuda derrota cáncer
    • 6.3 Comparación del genoma
    • 6.4 Ayudar a curar la Distrofia Muscular – fase 1
    • 6.5 Descubrir drogas Dengue – juntos
    • 6.6 El proyecto de energía limpia – fase 1
    • 6.7 Búsqueda de drogas antivirales gripe
    • 6.8 Arroz nutritivo para el mundo
    • 6.9 Ayudar a curar la Distrofia Muscular – fase 2
    • 6.10 Informática para sostenible del agua
    • 6.11 Descubrir drogas Dengue – juntos – fase 2
    • 6.12 Ayudar a vencer el cáncer
    • 6.13 IR a pelear contra la Malaria proyecto
    • 6.14 Plegamiento del proteoma humano – fase 2
    • 6.15 Búsqueda de medicamentos para la Leishmaniasis
    • 6.16 Informática para el agua potable
  • 7 Proyectos inactivos
    • 7.1 AfricanClimate@Home
  • 8 Referencias
  • 9 Enlaces externos

Historia

En 2003, IBM y otros participantes en la investigación patrocinada por la Proyecto de red de investigación viruela para acelerar el descubrimiento de una cura para el viruela.[8] El estudio de la viruela utilizó una red informática distribuida masiva analizar eficacia compuestos contra la viruela.[9] El proyecto permitió a los científicos detectar moléculas de drogas potenciales 35 millones contra varias proteínas de la viruela para identificar los buenos candidatos para convertirse en tratamientos de la viruela. En las primeras 72 horas, 100.000 resultados fueron devueltos. Al final del proyecto, 44 candidatos fuertes tratamiento habían sido identificados.[10] Basado en el éxito del estudio de la viruela, IBM anunciada la creación de la World Community Grid el 16 de noviembre de 2004, con el objetivo de crear un entorno técnico donde otra investigación humanitaria podría ser procesado.[1][9]

Mundo Community Grid inicialmente sólo compatible Windows, utilizando la propiedad Rejilla MP software de Dispositivos Unidos que potencia la Grid.org proyectos de computación distribuida. Demanda de soporte Linux condujo a la adición en noviembre de 2005 de open source BOINC tecnología grid que impulsa proyectos tales como SETI@Home y Climateprediction,[11] y Mac OS X y Linux se agregó soporte desde la introducción de BOINC.[4] En 2007, el World Community Grid emigrado de rejilla MP a BOINC para todas sus plataformas soportadas.[12]

Escala del proyecto

A partir de abril de 2014, World Community Grid tenía más de 73.000 cuentas de usuario activo, con más de 269.000 dispositivos activos.[2] En el transcurso del proyecto, han donado más de 957.000 acumulados años de tiempo de computación, y workunits sobre 2 billones han sido completados.[7]

Operación

El software de cliente de World Community Grid funciona en segundo plano, mostrándose como un pequeño icono en la bandeja del sistema. Cuando el BOINC cliente se utiliza, como en este ejemplo, el icono es una pequeña "b".
Ventana de estado del software cliente, mostrando información sobre el trabajo que actualmente están realizando en el fondo. Esta computadora particular es 60.3% completo con su workunit actual. Cuando llegue a 100%, se iniciará en un workunit nuevo y los resultados de la workunit anterior se transmitirán a WCG.

El software World Community Grid utiliza el tiempo de inactividad de Internet-conectar ordenadores para realizar cálculos de investigación.[13] Los usuarios instalan software de cliente WCG en sus computadoras. Este software funciona en el fondo, usando los recursos del sistema de repuesto para procesar trabajos de WCG.[13][14] Cuando una pieza de trabajo o workunit es terminado, el software cliente envía a WCG por Internet y descargas un nuevo workunit.[3][15] Para asegurar la precisión, los servidores WCG envían copias múltiples de cada workunit.[16] Entonces, cuando se reciben los resultados, son recogidos y validados contra el otro.[17][18] Los usuarios pueden optar por utilizar la salida de gráficos por la workunit actual como una protector de pantalla.

Mientras que muchas redes informáticas públicas tales como SETI@Home y Folding@Home están dedicados a un único proyecto, ofrece World Community Grid humanitaria múltiples proyectos bajo un solo paraguas. Los usuarios están incluidos en todos los proyectos de forma predeterminada, pero pueden optar por proyectos como eligen.[19]

Cuando lanzó el World Community Grid, usaron el propietario Rejilla MP cliente de Dispositivos Unidos. Después de agregar soporte para el fuente abierta BOINC cliente en 2005, World Community Grid eventualmente discontinuado al cliente de red MP y consolidada en la plataforma BOINC en 2008.[20]

Aunque WCG hace uso del software de cliente de código abierto, las aplicaciones actuales que realizan los cálculos científicos no puede ser. Sin embargo, varias de las aplicaciones de la ciencia están disponibles bajo una licencia libre, aunque la fuente no está disponible directamente en WCG.[21]

Problemas potenciales

La imagen muestra particular dos CPU uso historia (bajo Hyper-threading) cuando BOINC software de cliente está procesando dos tareas en cada CPU bajo Microsoft Windows XP SP2. Historia de uso de CPU indica casi 0% a 100% de oscilación con pico a pico de 3 segundos intervalo, cuando ve + actualización velocidad ajustada a alto, en el período de grabación de la primera mitad. El resto de mitad de período de la historia se establece para actualizar a velocidad normal e historia de uso de CPU superior indica un poco más del 60% e historia de uso de CPU baja muestran aproximadamente 35% en promedio.

Porque aumenta el software World Community Grid CPU uso por consumir sin usar el tiempo de procesamiento, es posible que el software para generar un comportamiento anormal en equipos voluntaria. Pese al carácter discreto del software, podrían producirse disminuciones en el rendimiento del sistema. Elevado uso de la CPU también podría causar una computadora (mal configurada) se sobrecaliente.

El BOINC cliente evita esta usando una variedad de límites que suspender el cómputo cuando hay suficientes recursos gratuitos. A diferencia de otros proyectos BOINC, World Community Grid establecer los valores predeterminados de BOINC conservador, haciendo extremadamente pequeñas las probabilidades de daños a la computadora. El acelerador de CPU predeterminado es 60%. El acelerador es de grano grueso; por ejemplo, si uso se establece en 60% que funciona al 100% durante 3 segundos, luego al 0% durante 2 segundos, dando como resultado una disminución promedio de uso del procesador.[22]

Un programa de complemento para ordenadores con Windows – TThrottle – puede solucionar el problema de recalentamiento limitando directamente uso del proyecto BOINC de la computadora host. Se hace esto mediante la medición de la CPU o la GPU temperatura y el tiempo de ejecución se ajusta en consecuencia. También utiliza un menor tiempo de conmutación de menos de un segundo, lo que resulta en menos cambios de temperatura durante la conmutación.

Las estadísticas y la competencia

Se registran los aportes de cada usuario y estadísticas de contribución de usuario están disponibles al público.[7] Debido al hecho de que el tiempo de procesamiento de cada workunit varía de PC a PC dependiendo de la dificultad de la workunit, la velocidad de la computadora y la cantidad de recursos ociosos disponibles, las contribuciones se miden generalmente en términos de puntos. Se otorgarán puntos para cada workunit según el esfuerzo necesario para procesar ese workunit.[23]

Al completar un workunit, el BOINC cliente solicitará el número de puntos que piensa que merece basado en software puntos de referencia (ver Sistema de crédito BOINC #Cobblestones). Puesto que varios equipos procesan la misma workunit para asegurar la precisión, los servidores de World Community Grid pueden mirar los puntos reclamados por cada uno de los equipos. Los servidores WCG ignorar a valores atípicos estadísticos, promedio de los valores restantes y otorgar al número resultante de puntos a cada equipo.[24][25]

Dentro de la red, los usuarios pueden unirse a los equipos que han sido creados por las organizaciones, grupos o individuos. Los equipos permiten un mayor sentido de identidad comunitaria y también pueden inspirar competencia. Como equipos compiten uno contra el otro, más trabajo es hecho por la red global.[26]

Extensión

World Community Grid reconoce a empresas y organizaciones como socios Si promocionan el WCG dentro de su empresa u organización. En fecha 21 de abril de 2014, WCG tenía 463 socios.[27]

También, como parte de su compromiso de mejorar la salud humana y el bienestar, los resultados de los cómputos completados el World Community Grid son liberados en el dominio público y puestos a disposición de la comunidad científica.[3]

Proyectos activos

FightAIDS@Home

Artículo principal: FightAIDS@Home

FightAIDS@Home (lanzado el 19 de noviembre de 2005[28]) fue el segundo proyecto de World Community Grid y su primer objetivo una sola enfermedad. Cada computadora individual procesa una molécula potencial de drogas y pruebas de cómo sería muelle con VIH proteasa, actuando como un inhibidor de la proteasa.[29] Scripps Research Institute publicó su primer artículo científico revisada sobre los resultados de FightAIDS@Home el 21 de abril de 2007.[30] Este documento explica que los resultados hasta ese momento se utilizará principalmente para mejorar la eficacia de futuros cálculos FightAIDS@Home.[31]

El 03 de febrero de 2010, el proyecto anunció que encontró dos compuestos que hacen posible una nueva clase de fármacos lucha contra el SIDA: "dos compuestos que actúan en sitios de unión de novela para una enzima usada por el virus de inmunodeficiencia humana (VIH), el virus que causa el SIDA. El descubrimiento abre el camino para el desarrollo de una nueva clase de fármacos anti-VIH para mejorar las terapias existentes, tratar las cepas farmacorresistentes de la enfermedad y retardar la evolución de la resistencia a los medicamentos en el virus."

Puede encontrarse el último informe de progreso (febrero de 2013) aquí.

Ayudar a cáncer infantil de lucha

Artículo principal: Ayudar a cáncer infantil de lucha

Ayudar a cáncer infantil de lucha proyecto (lanzado el 13 de marzo de 2009[32]) es patrocinado por los científicos en Chiba Cancer Center Research Institute y Universidad de Chiba.[33] La misión del proyecto ayuda cáncer infantil luchar es encontrar fármacos que pueden desactivar tres proteínas particulares asociadas con neuroblastomaque ocurren con frecuencia una de las más tumores sólidos en los niños. Identificación de estas drogas podría potencialmente hacer la enfermedad mucho más curable cuando se combina con tratamiento de quimioterapia.[34]

En el último informe de estado de marzo de 2013, disponible aquí, los científicos informan que para la proteína T1 (el primero fuera, hasta el momento, 10 objetivos analizados en la WCG), se han encontrado dos tipos de compuestos químicos y que estos resultados se han sometido a la revista de investigación del cáncer. En febrero de 2014, se informó que los científicos del proyecto tenían seleccionados 7 compuestos que efectivamente destruyen las células del neuroblastoma sin efectos secundarios aparentes y ahora están buscando un socio farmacéutico para perseguir estas pistas. El artículo WCG está disponible aquí mientras que el documento fue publicado en la revista revisada por pares Medicina para el cáncer aquí

El proyecto de energía limpia – fase 2

Artículo principal: Proyecto de energía limpia

El proyecto de energía limpia (lanzado el 28 de junio de 2010[35]) es patrocinado por los científicos de La Universidad de Harvardel Departamento de química y Biología química.[36] La misión de los proyectos de energía limpia es encontrar nuevos materiales para la próxima generación de células solares y después, almacenamiento de energía dispositivos. Los investigadores están empleando mecánica molecular y estructura electrónica cálculos para predecir la óptica y las propiedades de las moléculas que podrían convertirse en la próxima generación de células solares materiales de transporte. Aprovechando la potencia de cálculo de la World Community Grid, los investigadores pueden calcular las propiedades electrónicas de decenas de miles de materiales orgánicos – muchos más de lo que podría ser probado en un laboratorio – y determinar a que los candidatos más prometedores para el desarrollo económico energía solar tecnología.[37] El 24 de junio de 2013, el proyecto de energía limpia liberó su base de datos al público y a la comunidad de investigación. El lanzamiento fue destacado en el Blog de casa blanca[38] y por noticias de varias organizaciones incluyendo el MIT Technology Review.[39] La base de datos contiene 150 millones los cálculos de teoría funcional de la densidad en 2,3 millones de moléculas.

Decir No a Schistosoma

Decir No a Schistosoma (lanzado el 22 de febrero de 2012[40]) es el proyecto de investigación XX a ser lanzado el World Community Grid. Los investigadores de Infórium Universidad en Belo Horizonte y FIOCRUZ-Minas, Brasil, apuntan a este proyecto en World Community Grid para realizar simulaciones por ordenador de las interacciones entre millones de compuestos químicos y ciertas proteínas blanco. Esto le ayudará a encontrar los compuestos más prometedores que pueden conducir a tratamientos eficaces para esquistosomiasis.[41]

A partir de febrero de 2013, los científicos informan que se probaron a 18 compuestos in vitro e in vivo. También informaron que un adicional 23 compuestos estaban siendo evaluado para ser probado.[42]

En agosto de 2013, se informó que el proyecto estaba listo para llevar a cabo pruebas en humanos basándose en sus conclusiones. Van a pedir autorización desde el Comité de ética de investigación brasileño que debe tomar entre 6 a 8 meses.[43]

Mapeo de marcadores de cáncer

Mapeo de marcadores de cáncer (lanzado el 08 de noviembre de 2013). El proyecto tiene como objetivo identificar los marcadores asociados con diversos tipos de cáncer. El proyecto está analizando millones de puntos de datos recogidos de miles de muestras de tejido de pacientes cancerosos y saludable. Estos incluyen los tejidos pulmonares, ovarios, próstata, páncreas y los cánceres de mama. Comparando estos puntos de datos diferentes, los investigadores pretenden identificar patrones de marcadores para diferentes tipos de cáncer y correlacionarlas con resultados diferentes, incluida la capacidad de respuesta a diversas opciones de tratamiento. El proyecto está procediendo en 4 fases con el primer enfoque sobre el cáncer de pulmón.[44][45]

Proyectos finalizados

Plegamiento del proteoma humano – fase 1

Artículo principal: Proyecto de proteoma humano plegable

El primer proyecto lanzado el World Community Grid fue el proyecto plegable del proteoma humano, o HPF1, que pretende predecir la estructura del ser humano proteínas. El proyecto fue lanzado el 16 de noviembre de 2004,[46] y terminada el 18 de julio de 2006.[46] Este proyecto era única en ese cómputo se realizó conjuntamente con el Grid.org proyecto de computación distribuida.[47] Ideado por Richard Bonneau en el Instituto de biología de sistemas, la red de proyecto utilizada computación para producir las estructuras probables para cada una de las proteínas con una puntuación de Rosetta. A estas predicciones, los investigadores esperan predecir la función de las proteínas innumerables. Esta mayor comprensión de las proteínas humanas podría resultar vital en la búsqueda de curas para humanos enfermedades.[48] Informática para este proyecto finalizó oficialmente el 18 de julio de 2006.[49] Se han publicado los resultados de investigación para la porción de levadura de HPF1.[50]

Ayuda derrota cáncer

Artículo principal: Ayuda derrota cáncer

El proyecto de ayuda derrota cáncer busca mejorar la capacidad de los profesionales médicos para determinar las mejores opciones de tratamiento para los pacientes con cáncer de cuello, cabeza o pecho. El proyecto fue lanzado el 20 de julio de 2006,[46] y terminado en abril de 2007.[46] El proyecto trabajado con la identificación de los patrones visuales en grandes cantidades de micromatrices tisulares toma de muestras de tejidos archivados. Al correlacionar los datos de patrones con información sobre tratamiento y resultados de los pacientes, los resultados de este proyecto podrían ayudar a proporcionar mejores opciones de tratamiento.[51]

Comparación del genoma

Artículo principal: Proyecto de comparación del genoma de Fiocruz

El proyecto genoma comparación es patrocinado por la Brasileño institución de investigación Fiocruz.[52] El proyecto fue lanzado el 21 de noviembre de 2006,[46] y completado el 21 de julio de 2007.[46] El proyecto busca comparar las secuencias de genes de diversos organismos uno contra el otro para encontrar similitudes entre ellos. Los científicos esperan descubrir qué propósito sirve una secuencia del gen particular en una función particular de un organismo, mediante comparación con una secuencia similar de genes de función conocida en otro organismo.[53]

Ayudar a curar la Distrofia Muscular – fase 1

Artículo principal: Ayudar a curar la Distrofia Muscular

Ayuda curar la Distrofia Muscular está a cargo de Décrypthon, una colaboración entre la Asociación francesa de Distrofia Muscular, Centro nacional francés de investigaciones científicas y IBM. Fase 1 fue lanzada el 19 de diciembre de 2006,[52] y terminado el 11 de junio de 2007.[54] El proyecto investigado interacciones proteína-proteína para 40.000 proteínas cuyas estructuras son conocidas, con especial énfasis en aquellas proteínas que desempeñan un papel en enfermedades neuromusculares. La base de datos de información ayudará a los investigadores diseño moléculas para inhibir o mejorar el atascamiento de particular macromoléculas, esperemos que conduce a mejores tratamientos para distrofia muscular y otras enfermedades neuromusculares.[55] Este proyecto estaba disponible solamente a agentes que se ejecutan los Rejilla MP cliente, haciéndolo disponible para los usuarios de BOINC.[56]

Descubrir drogas Dengue – juntos

Artículo principal: Descubrir drogas Dengue – juntos

Descubrir drogas Dengue – juntos es patrocinado por los científicos de la Universidad de Texas y el Universidad de Chicago y se ejecutará en dos fases.[57] Fase 1, lanzada el 21 de agosto de 2007,[52] utiliza AutoDock 2007 (el mismo software utilizado para FightAIDS@Home) para probar posibles fármacos antivirales (a través de NS3 proteasa inhibición) contra los virus de la familia Flaviviridae y terminado el 11 de agosto de 2009.[58][59] Fase 2 "[USA] un programa de cómputo más intensivo a los candidatos que lo hacen a través de la fase 1 de la pantalla."[60] Los fármacos candidatos que lo hacen a través de la fase 2 será probada en laboratorio.[60]

El proyecto de energía limpia – fase 1

Artículo principal: Proyecto de energía limpia

El proyecto de energía limpia es patrocinado por los científicos de La Universidad de Harvardel Departamento de química y Biología química.[36] Fase 1 fue lanzada el 05 de diciembre de 2008 y completó el 13 de octubre de 2009.[61] La misión de los proyectos de energía limpia es encontrar nuevos materiales para la próxima generación de células solares y después, almacenamiento de energía dispositivos. Los investigadores están empleando mecánica molecular y estructura electrónica cálculos para predecir la óptica y las propiedades de las moléculas que podrían convertirse en la próxima generación de células solares materiales de transporte. Aprovechando la potencia de cálculo de la World Community Grid, los investigadores fueron capaces de calcular las propiedades electrónicas de decenas de miles de materiales orgánicos – muchos más de lo que podría ser probado en un laboratorio – y determinar a que los candidatos más prometedores para el desarrollo económico energía solar tecnología.[62]

Búsqueda de drogas antivirales gripe

Artículo principal: Búsqueda de drogas antivirales gripe

Proyecto de búsqueda de drogas antivirales gripe es patrocinado por Dr. Stan Watowich y su equipo de investigación en La Universidad de Texas (Rama médicaGalveston, TexasESTADOS UNIDOS).[63] El proyecto fue lanzado el 05 de mayo de 2009 y se completó el 22 de octubre de 2009.[64] La misión de la Influenza Fármaco antiviral Buscar en proyecto es encontrar nuevos medicamentos que pueden detener la propagación de una gripe infección en el cuerpo. La investigación dirigirá específicamente a las cepas de influenza que se han vuelto resistentes a los medicamentos así como nuevas cepas que están apareciendo. Identificación de los compuestos químicos que son los mejores candidatos a acelerar los esfuerzos para desarrollar tratamientos que serían útiles en el manejo de los brotes de gripe estacional y gripe futuras epidemias y pandemias incluso.[65] Fase 1 del proyecto de la búsqueda de drogas antivirales gripe ya ha terminado el 22 de octubre de 2009. Ahora los investigadores están realizando procesamiento posterior de los resultados de la fase 1 y se preparan para la fase 2.[64]

En noviembre de 2012, los científicos del proyecto señaló que, dado el hecho de que no hay ningún peligro de un brote de gripe, todos los resultados del proyecto se publicará en línea y sus recursos podría ser reorientados en el proyecto del Dengue.[66]

Arroz nutritivo para el mundo

Artículo principal: Arroz nutritivo para el mundo

El Arroz nutritivo para el mundo proyecto se lleva a cabo por Ram Samudralaes Grupo de investigación en biología computacional en el Universidad de Washington. El proyecto fue lanzado el 12 de mayo de 2008 y completó el 06 de abril de 2010.[67] El propósito de este proyecto es predecir la estructura del proteínas de mayor cepas de arroz, con el fin de ayudar a agricultores raza mejor arroz cepas con mayor rendimientos de los cultivos, promover una mayor enfermedad y Pest resistencia y utilizar una amplia gama de biodisponible nutrientes que puede beneficiar a personas alrededor del mundo, especialmente en las regiones donde desnutrición es una preocupación crítica. El proyecto ha sido cubierto por más de 200 medios de comunicación desde sus inicios.[68] El 13 de abril de 2010, World Community Grid anunció oficialmente que el arroz nutritivo para el proyecto mundo terminado en 06 de abril de 2010.[67]

En abril de 2014, fue publicada una actualización indicando que el equipo de investigación pudo publicar información estructural sobre miles de proteínas y avanzar el campo de la modelización computacional de la proteína. Estos resultados – que sólo fueron posibles debido a la enorme cantidad de computación donados de la energía tenía disponible – se espera orientar futuras investigaciones y esfuerzos de la ciencia de la planta.[69]

Ayudar a curar la Distrofia Muscular – fase 2

Artículo principal: Ayudar a curar la Distrofia Muscular

World Community Grid y los investigadores apoyados por Decrypthon, una asociación entre AFM (Asociación de la Distrofia Muscular francesa), CNRS (Centro nacional francés de investigaciones científicas), Universite Pierre et Marie Curie e IBM estaban investigando interacciones proteína-proteína más de 2.200 proteínas cuyas estructuras son conocidas, con especial énfasis en aquellas proteínas que desempeñan un papel en enfermedades neuromusculares. Fase 2 fue lanzado el 12 de mayo de 2009,[70] y terminada el 26 de septiembre de 2012. La base de datos de información ayudará a los investigadores diseño moléculas para inhibir o mejorar el atascamiento de particular macromoléculas, esperemos que conduce a mejores tratamientos para distrofia muscular y otras enfermedades neuromusculares.[71]

Fase 2 del proyecto ayudar a curar la Distrofia Muscular comenzó una vez que se analizaron los resultados de la primera fase. Fase 2 funcionó en el BOINC plataforma.[20][72]

Informática para sostenible del agua

Informática para sostenible del agua fue el proyecto de investigación 21 para ser lanzado el World Community Grid. Los investigadores de la Universidad de Virginia se ejecuta este proyecto en World Community Grid para estudiar los efectos de la actividad humana en una gran Cuenca y ganar penetraciones profundas en qué acciones pueden apoyar la restauración, la salud y la sostenibilidad de este recurso de agua importante.[73] El proyecto fue lanzado el 17 de abril de 2012,[74] y completado el 17 de octubre de 2012.

Descubrir drogas Dengue – juntos – fase 2

Artículo principal: Descubrir drogas Dengue - juntos

Descubrir drogas Dengue – juntos – fase 2 (lanzado el 17 de febrero de 2010[75]) es patrocinado por La rama médica de la Universidad de Texas (UTMB) en Galveston, Texas, ESTADOS UNIDOS y el Universidad de Chicago en IllinoisESTADOS UNIDOS. La misión es identificar candidatos prometedores medicamentos para combatir la Dengue, Hepatitis C, Del oeste del Nilo, Fiebre amarillay otros virus relacionados. La potencia informática extensa del World Community Grid se utilizará para completar los cálculos de descubrimiento de medicamentos basados en la estructura necesarios para identificar a estos fármacos candidatos.[76]

El proyecto terminó en marzo de 2013. Para inhibir las proteasas de virus de Dengue tanto del oeste del Nilo se han descubierto compuestos químicos. Un puñado de análogos desarrollado a partir de las pistas iniciales del dengue computadora descubiertos han entrado cruciales estudios pre-clínicos de farmacocinética y eficacia.[77]

Ayudar a vencer el cáncer

Artículo principal: Ayudar a vencer el cáncer

Ayudar a vencer el cáncer proyecto (lanzado el 01 de noviembre de 2007[78]) es patrocinado por la Ontario Cancer Institute (OCI), Hospital Princess Margaret y red de salud de la Universidad de Toronto, Canadá. El proyecto implica Cristalografía de rayos x. La misión de ayudar a conquistar cáncer es mejorar los resultados de la proteína Cristalografía de rayos x, que ayuda a los investigadores no sólo anotar piezas desconocidas del proteoma humano, pero lo importante mejora su comprensión del cáncer iniciación, progresión y tratamiento.[79]

El proyecto HCC fue el primer proyecto WCG beneficiándose de GPU que ayudó a terminar mucho antes de lo proyectado inicialmente debido a la enorme potencia de GPU. En el informe de estado de abril del de 2013, disponible aquí, informe de los científicos todavía hay un montón de datos para analizar, pero que están preparando un nuevo proyecto que buscará para firmas pronósticas y predictivas (conjuntos de genes, proteínas, microRNAs, etc.) que ayudan a predecir la supervivencia de los pacientes y respuesta al tratamiento. El proyecto terminó en mayo de 2013.

IR a pelear contra la Malaria proyecto

La misión de la IR a pelear contra la Malaria proyecto (lanzado el 16 de noviembre de 2011[80]) es descubrir fármacos candidatos prometedores que podrían desarrollarse en nuevos medicamentos que curan las formas resistentes a los fármacos de malaria. La potencia informática del World Community Grid se utilizará para llevar a cabo simulaciones por ordenador de las interacciones entre millones de compuestos químicos y ciertas proteínas blanco, para predecir su capacidad para eliminar la malaria. Se probará los mejores compuestos por científicos en El Instituto de Investigación Scripps de La Jolla, California, Estados Unidos y además se convirtió en posibles tratamientos para la enfermedad.[81]

En el último informe, publicado en noviembre de 2012 y está disponible aquí, los científicos informaron que se habían encontrados varios compuestos que inhiben la actividad de virus. 20 compuestos fueron ordenados, 19 llegó en realidad, de los cuales 3 no eran solubles. De los restantes 16, 7 había inhibida Mtb InhA(Mycobacterium tuberculosis). El mejor golpe muestra un valor de IC50 de aproximadamente 40 micro-Molar. El descubrimiento de este compuesto es importante debido a las superbacterias resistentes a los fármacos de Mycobacterium tuberculosis.

El 22 de mayo, fue anunció que el proyecto estaba entrando en las etapas finales y debería terminar pronto.

Plegamiento del proteoma humano – fase 2

Artículo principal: Proyecto de proteoma humano plegable

Proteoma humano plegable - fase 2 (HPF2) (lanzado el 23 de junio de 2006[52]) fue el tercer proyecto en World Community Grid. Este proyecto, a raíz de HPF1, se centra en humanos-secretada proteínas, con especial énfasis en biomarcadores y las proteínas en la superficie de las células así como Plasmodium, el organismo que causa la malaria. HPF2 genera modelos de proteína de alta resolución de HPF1. Aunque estos modelos de alta resolución son más útiles, también requieren más potencia de procesamiento para generar.[82]

En un informe de estado de julio de 2012, los científicos del proyecto informaron que los resultados generados por los cálculos de WCG están siendo utilizados por el Dr. Markus Landthaler del Max Delbruch centro de Medicina Molecular (MDC) en Berlín. Los resultados HPF2 ayudó a Dr. Markus Landthaler y sus colaboradores en escribir un nuevo libro sobre "El proteoma de mRNA-limite y su perfil Global de ocupación en las transcripciones proteína-codificación" disponible aquí. Más documentos que describen los resultados del proyecto HPF2 están disponibles en su sitio web.

Búsqueda de medicamentos para la Leishmaniasis

Búsqueda de medicamentos para la Leishmaniasis (lanzado el 07 de septiembre de 2011[83]) está encabezada por el Universidad de Antioquia en Medellín, Colombia, con la asistencia de investigadores de la Universidad de Texas Medical Branch en Galveston, Texas. La misión es identificar a posibles candidatos de la molécula que posiblemente podrían ser convertidos en tratamientos para Leishmaniasis. La potencia informática extensa del World Community Grid se utilizará para llevar a cabo simulaciones por ordenador de las interacciones entre millones de compuestos químicos y ciertas proteínas blanco. Esto ayudará a encontrar los compuestos más prometedores que pueden conducir a tratamientos eficaces para la enfermedad.[84]

En abril de 2014, los científicos del proyecto informaron que se había registrado casi el 85% de los datos generados por los voluntarios de la red de comunidad mundial y que iban a comenzar las pruebas entre 10 a 20 compuestos que interactuaban con tres proteínas de Leishmania en en silico las pruebas.[85]

Informática para el agua potable

Informática para el agua potable (lanzado el 20 de septiembre de 2010[86][87]) es patrocinado por el centro de Nano y Micro mecánica de La Universidad de Tsinghua en Beijing. La misión del proyecto es proporcionar la penetración más profunda en la escala molecular en los orígenes del flujo eficiente de agua a través de una nueva clase de materiales filtrantes. Esta penetración alternadamente guiará el futuro desarrollo de filtros de agua más eficiente y de bajo costo. Se estima que 1,2 billones de personas carecen de acceso al agua potable, y 2,6 billones tienen poco o ningún saneamiento. Como resultado, millones de personas mueren todos los años – aproximadamente 3.900 niños al día debido a la falta de agua limpia.[88] El 25 de abril de 2014, los científicos del proyecto lanzado una actualización indicando que tenían resultados emocionantes para informar cuando se envía el documento y que había terminado el proyecto WCG.[89]

Proyectos inactivos

AfricanClimate@Home

La misión de AfricanClimate@Home fue desarrollar modelos climáticos más precisos de regiones específicas en África. Se pretende servir como una base para la comprensión de cómo el clima cambiará en el futuro por lo que medidas destinadas a paliar los efectos adversos del cambio climático podría ser implementada. Tremenda potencia informática del World Community Grid se utilizó para comprender y reducir la incertidumbre con la cual se simularon los procesos climáticos en África. Fase 1 del Climate@Home africano lanzado el 03 de septiembre de 2007,[90] y terminó en julio de 2008.[91] Actualmente no hay planes para una segunda fase.

Referencias

  1. ^ a b "IBM presenta ' World Community Grid'" (Comunicado de prensa). IBM. 16 de noviembre de 2004. 11 de febrero de 2009.
  2. ^ a b c d e f g "Panorama mundial comunidad Grid crédito". BOINCstats. 07 de julio de 2014.
  3. ^ a b c "Quienes somos". World Community Grid. 28 de julio de 2007.
  4. ^ a b "Requisitos del sistema". Ayuda. World Community Grid. 28 de julio de 2007.
  5. ^ "get_project_config.php". World Community Grid. 28 de julio de 2007.
  6. ^ "16 11 2010, feliz cumpleaños, World Community Grid!". World Community Grid. 16 de noviembre de 2010. 17 de noviembre de 2010.
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Enlaces externos

  • World Community Grid
  • Estadísticas globales de World Community Grid
  • IBM - cómo funciona - World Community Grid - EEUU
  • Actualización de noticias y guías sobre World Community Grid y otros proyectos BOINC
  • Voz de la historia de América (junio de 2008)
  • El New York Times > tecnología > energía sin usar PC a cuadrícula para desenredar la enfermedad
  • Comunidad virtual del universo y la informatización en red basados en proyectos de voluntariado de mundos virtuales
  • Volunteer@Home.com Todo sobre computación voluntaria
  • Artículo de Computerworld del anuncio (2004)

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