El Atlas del genoma de cáncer

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El Atlas del genoma de cáncer (TCGA) es un proyecto iniciado en 2005, para catalogar mutaciones genéticas responsable de la cáncer, utilizando secuenciación del genoma y Bioinformática.[1][2] TCGA se aplica técnicas de análisis de genoma de alto rendimiento para mejorar nuestra capacidad para diagnosticar, tratar y prevenir el cáncer a través de una mejor comprensión de la base genética de esta enfermedad.

TCGA es supervisado por el Instituto Nacional del cáncer's Centro para la genómica del cáncer y de la National Human genoma Research Institute financiado por el gobierno de Estados Unidos. Un proyecto piloto de tres años, iniciado en 2006, se centró en la caracterización de tres tipos de cánceres humanos: multiforme de glioblastoma, pulmón, y cáncer de ovario.[3] En 2009, se expandió en fase II, que planea completar la caracterización genómica y análisis de la secuencia de tipos de tumores diferentes de 20-25 para el año 2014. TCGA superó ese objetivo, caracterizar 33 tipos de cáncer, incluyendo cánceres raros 10.[4][5] La financiación se divide entre centros de la caracterización del genoma (CG), que realizan la secuencia, y genoma análisis centros de datos (GDACs) que realizan los análisis bioinformáticos.

El proyecto había previsto de 500 muestras de pacientes, más que la mayoría estudios de genómica y utiliza diferentes técnicas para analizar las muestras de pacientes. Las técnicas incluyen Perfil de expresión génica, variación en número de copias perfiles, Genotipado SNP, amplia de genoma Metilación del ADN perfiles, microRNA perfiles, y exón secuencia de al menos 1.200 genes. TCGA está secuenciando el genoma entero de algunos tumores, incluyendo por lo menos 6.000 genes candidatos y secuencias de microARN. Este objetivo de secuenciación se está realizando por los tres centros de secuenciación utilizando tecnología de captura de híbridos. En la fase II, TCGA realiza una secuenciación del exón todo en 80% de los casos y la secuenciación del genoma entero en un 80% de los casos utilizados en el proyecto.

Contenido

  • 1 Objetivos
  • 2 Gestión
  • 3 Acumulación de tejido
  • 4 Financiación
  • 5 Organización
    • 5.1 Recursos de base de muestra biológica
    • 5.2 Centros de secuenciación del genoma
    • 5.3 Centros de caracterización del genoma
    • 5.4 Centro Coordinador de datos
    • 5.5 Centros de análisis de datos de genoma
  • 6 Tumores
  • 7 Publicaciones
    • 7.1 Multiforme de glioblastoma
    • 7.2 Seroso ovárico
    • 7.3 Carcinoma colorrectal
    • 7.4 Estado a partir de 2013: paisaje mutacional de subtipos de cáncer común 12
  • 8 Véase también
  • 9 Referencias
  • 10 Acoplamientos externos

Objetivos

El objetivo del proyecto piloto fue demostrar que las tecnologías avanzadas de genómicas pueden ser utilizadas por un equipo de científicos de diversas instituciones para generar conclusiones estadísticamente y biológicamente significativas del conjunto de datos genómico generado.[6] Se analizaron dos tipos de tumor durante la fase piloto, Multiforma de Glioblastoma (GBM) y Cistoadenocarcinoma de ovario. TCGA fase II pretende ampliar el éxito experimentado en el proyecto piloto para más tipos de cáncer, proporcionando un conjunto de datos grande, estadísticamente significativo para el descubrimiento de más. Más información sobre TCGA está disponible en el (TCGA) página de iniciohttps://cancergenome.nih.gov/) y datos TCGA se pueden acceder a través del Portal de datos TCGA (https://TCGA-Data.NCI.nih.gov/TCGA/).

Gestión

TCGA está gestionado conjuntamente por científicos y directivos del Instituto Nacional del cáncer (NCI) y el nacional humano genoma Research Institute (NHGRI). Con la expansión del TCGA de la fase piloto de fase II en octubre de 2009, el NCI creó una oficina de programa TCGA. Esta oficina es responsable de la operación de seis centros de caracterización del genoma, siete centros de análisis de genoma, el recurso base de muestra biológica, el centro de coordinación de datos y aproximadamente un tercio de la secuenciación realizada para el proyecto por los tres centros de secuenciación del genoma.[7] Además, la oficina del proyecto TCGA es responsable de coordinar la acumulación de tejidos para TCGA. Carolyn Hutter, Gerente de proyecto de NHGRI, dirige dos tercios de la secuenciación en los centros de secuenciación del genoma.

El proyecto es dirigido por un equipo de proyecto compuesto por miembros del NCI y el NHGRI. Este equipo, junto con los investigadores principales, financiado por el proyecto, conforma el Comité de dirección. El Comité Directivo se encarga de velar por la validez científica del proyecto y el equipo del proyecto NCI/NHGRI asegura que el progreso científico y los objetivos del proyecto se cumplen, el proyecto se complete a tiempo y de presupuesto y la coordinación de los distintos componentes del proyecto.

Acumulación de tejido

Requisitos de tejido varían del tipo de tejido para el tipo de tejido y del tipo de cáncer tipo de cáncer. Expertos en enfermedad de enfermedad de grupos del proyecto de trabajo ayudó a definir las características de las muestras de tejido típico devengan como "estándar de atención" en los Estados Unidos y cómo TCGA puede utilizar mejor el tejido. Por ejemplo, la Enfermedad del cerebro Grupo de trabajo determinó que las muestras que contienen más del 50% necrosis no sería conveniente para el TCGA y que el 80% el tumor núcleos fueron requeridos en la parte viable del tumor. TCGA había seguido algunas pautas generales como punto de partida para recoger muestras de cualquier tipo de tumor. Estos incluyen un mínimo de 200mg en tamaño, no menos de 80% los núcleos del tumor y una fuente emparejada de línea germinal ADN (tales como sangre o ADN purificado). Además, instituciones presentar tejidos TCGA deben tener un conjunto mínimo de datos clínico definidos por el grupo de trabajo de la enfermedad, firmaron consentimientos que han sido aprobados por la IRB de su institución, así como un acuerdo de transferencia de material con TCGA.

En 2009, el NCI eliminado aproximadamente $ 130 millones de ARRA del NCI "primer contrato" con ciencia aplicaciones International Corporation (SAIC) para financiar la acumulación de tejido y una variedad de otras actividades a través de la oficina de adquisición de NCI. $ 42 millones estaba disponible para la acumulación de tejido a través del NCI utilizando "Las solicitudes para citas" (RFQs) y "Solicitudes para propuestas" (RFPs) para generar órdenes de compra y contratos, respectivamente. Wereprimarily solicitudes de presupuesto utilizado para la recogida de muestras retrospectivas de bancos establecidos mientras que la RFP se utiliza para la recogida prospectiva de muestras. TCGA finalizado la recogida de la muestra en diciembre de 2013, con casi 20.000 hay.[8]

Instituciones que aportan muestras TCGA se pagan y tienen acceso a datos moleculares generados en sus muestras, manteniendo un vínculo entre el identificador único del TCGA y su propio identificador único. Esto permite contribuir instituciones que enlace a los datos clínicos para sus muestras y colaboraciones con otras instituciones que tienen datos similares en muestras TCGA, aumentando así el poder de análisis de resultados.

Financiación

El NCI y el NHGRI igualmente habían cofinanciado el proyecto piloto con M $50 para los tres primeros años. El NCI ha comprometido $25M/año de fondos asignados durante cinco años para la TCGA fase II. El NHGRI ha comprometido $25M/año de fondos asignados para dos años. El comienzo de la segunda fase del proyecto coincidió con la recuperación y reinversión de 2009 (ARRA), proporcionando $153. 5M de fondos adicionales para el NCI más allá de sus fondos asignados. La oficina del Director de la NIH ha proporcionado otro $25 M de los fondos ARRA, dedicada al análisis de la secuencia y otro $25 M de los fondos ARRA en el segundo año de la fase II si es progresos sustanciales durante el año 1. En total, $150 millones se gastará en secuencia. Otro $70 M se gastará en la acumulación de tejido, muestra del control de calidad y aislamiento de biomoléculas (ADN y ARN).

Organización

TCGA tiene un número de diferentes tipos de centros que son financiados para generar y analizar datos. TCGA es el primer proyecto de genómica a gran escala financiado por el NIH para incluir recursos importantes para el descubrimiento de la bioinformática. El NCI ha dedicado el 50% de fondos TCGA apropiada, aproximadamente $12M/año, al descubrimiento de Bioinformática de fondo. Centros de secuenciación del genoma genoma caracterización centros generan datos. Dos tipos de centros de análisis de datos de genoma utilizan los datos para el descubrimiento de la bioinformática. Dos centros son financiados para aislar biomoléculas de las muestras del paciente y un centro es financiado para almacenar los datos. Para más información sobre la organización del proyecto TCGA, ver https://cancergenome.nih.gov/NewsEvents/multimedialibrary/Interactives/howitworks.

Recursos de base de muestra biológica

Los recursos de base de muestra biológica (BCR) es responsable de verificar la calidad y cantidad del tejido enviado por sitios de origen de tejido, el aislamiento de ADN y ARN de las muestras, control de calidad de estas biomoléculas y el envío de muestras al GSCs y CG. El consorcio internacional de genómica se adjudicó el contrato para iniciar el BCR para el proyecto piloto. Había dos BCRs financiados por el NCI en el inicio del proyecto completo: Hospital de niños en todo el país y el consorcio internacional de genómica. El BCR se recompeted con la debida fecha de propuestas 04 de junio de 2010 y el Hospital de niños en todo el país se adjudicó el contrato.[9]

Centros de secuenciación del genoma

Tres centros de secuenciación del genoma fue financiados por el NCI y el NHGRI: el Instituto Broad, El centro de genoma en la Universidad de Washington y Universidad de Baylor de la medicina. Han pasado los tres de estos centros de secuenciación de Sanger secuenciación para secuenciación de próxima generación (NGS), aunque una variedad de tecnologías NGS se llevan a cabo simultáneamente.

Centros de caracterización del genoma

El NCI financiado por siete centros de caracterización del genoma: el Instituto Broad, Harvard, Universidad de North Carolina, MD Anderson cáncer Center, Van Andel Instituto, Baylor College of Medicine y el centro de cáncer de Columbia Británica.

Centro Coordinador de datos

El centro de coordinación de datos es el repositorio central de datos TCGA. También es responsable del control de calidad de datos en la base de datos TCGA. El DCC también mantiene el Portal de datos TCGA que es donde los usuarios acceder a datos TCGA. Este trabajo se realiza bajo contrato por bioinformática científicos y desarrolladores de SRA International, Inc. El DCC no sede de niveles más bajos de datos de la secuencia. De NCI Centro de genómica del cáncer (CGHub) es el repositorio seguro de almacenamiento, catalogación y acceso a los datos relacionados con la secuencia. Este trabajo se realiza bajo contrato por científicos y personal de la Universidad de California, Santa Cruz.

Centros de análisis de datos de genoma

Siete centros de análisis de datos genoma financiados por el NCI/NHGRI son responsables de la integración de datos a través de toda caracterización y secuenciación centros así como de la interpretación biológica de los TCGA datos. El GDACs incluyen el Instituto Broad, salud de la Universidad de Carolina del norte, Oregon y la Universidad de Ciencias, Universidad de California en Santa Cruz, MD Anderson Cancer Center, Memorial Sloan Kettering Cancer Center y el Instituto de Biología de sistemas. Siete GDACs todos trabajan juntos para desarrollar un gasoducto de análisis para el análisis automatizado de los datos.

Tumores

Una lista preliminar de tumores para TCGA a estudiar se generó mediante la compilación de las estadísticas de incidencia y supervivencia de la VIDENTE cáncer estadística web (https://SEER.cancer.gov/). Además, Estados Unidos actual "Estándar de atención" consideró al elegir los tipos de tumor de top 25, TCGA se dirige a tipos del tumor donde la resección antes de la terapia adjunta es el estándar del cuidado. La disponibilidad de muestras también juega un papel crítico en la determinación de los tipos de tumor a estudio y el orden en que el tumor se inician proyectos. El tumor más común es, más probable que las muestras se se acumular rápidamente, dando por resultado los tipos comunes de tumor, como colon, pulmón y cáncer de mama, convirtiéndose en los primeros tipos de tumor entró en el proyecto, antes de tipos de tumores raros.

TCGA dirigidos a tumores: carcinoma de células escamosas de pulmón, carcinoma papilar de riñón, carcinoma renal de células claras, carcinoma ductal de mama, carcinoma de células renales, cáncer de cuello uterino (escamosas), adenocarcinoma de colon, adenocarcinoma de estómago, carcinoma rectal, carcinoma hepatocelular, De cabeza y cuello de células escamosas (oral), carcinoma de la tiroides, carcinoma urotelial de vejiga -nonpapillary, (del cuerpo uterinocarcinoma endometrial), adenocarcinoma ductal pancreática, leucemia mieloide aguda, adenocarcinoma de próstata, adenocarcinoma de pulmón, melanoma cutáneo, carcinoma lobulillar de mama y glioma bajo grado, carcinoma del esófago, cystadenocarcinoma seroso ovárico, carcinoma de células escamosas de pulmón, carcinoma adrenocortical, Células B grandes linfoma difuso, paraganglioma y feocromocitoma, colangiocarcinoma, carcinosarcoma uterino, melanoma uveal, thymoma, sarcoma de, mesotelioma, y cáncer testicular de células germinales.

TCGA acumulado muestras para todos estos tipos de tumor al mismo tiempo. Como muestras se convirtieron disponibles, los tipos de tumor con más muestras acumuladas fueron entró en producción. Para más tipos de tumor raro, tumor tipos donde las muestras son difíciles de acumular y de tipos del tumor donde TCGA no puede identificar una fuente de muestras de alta calidad, estos tipos de cáncer entraron en la "tubería de producción TCGA" en el segundo año del proyecto. Esto dio el tiempo adicional de la oficina del programa TCGA acumular suficientes muestras para el proyecto.

Publicaciones

Progreso a partir del 25 de octubre de 2015
Tipo de cáncer que estudió Final

Número de casos [10]

 Datos públicamente disponibles TCGA análisis resultados
Glioblastoma Multiforme 528 X Subtipos GBM clásico, mesenquimal y proneurales se definen por las mutaciones de EGFR, NF1 y PDGFRA/IDH1 respectivamente;[11] Más del 40% de los tumores tienen mutaciones en genes modificadores de la cromatina;[12] Otros genes mutados con frecuencia incluyen TP53, PlK3R1, PIK3CA, IDH1, PTEN, RB1, LZTR1[13]
Glioma bajo grado 516 X Definido tres subtipos el correlato con los resultados del paciente: IDH1 mutante con eliminación de 1 p/19q, mutante IDH sin 1 eliminación p/19q y wildtype IDH; Wildtype IDH es genómicamente similar al glioblastoma[14]
Carcinoma lobulillar de mama 127[15] X Carcinoma lobulillar de Carcinoma Ductal; FOXA1 elevada en el Carcinoma lobulillar, GATA3 en Carcinoma Ductal; Carcinoma lobulillar enriquecido para la pérdida PTEN y la activación de Akt[16]
Carcinoma Ductal de mama > 800 X Cuatro subtipos Basal, Her2, Luminal A, Luminal B difiere en el perfil genómico; más común conductor las mutaciones TP53, PIK3CA, GATA3; Subtipo basal similar a cáncer de ovario seroso[15]
Adenocarcinoma colorrectal 632 X Cáncer de colon y Rectal tiene similares perfiles genómicos; Hypermutated subtipo (16% de las muestras) sobre todo encontrado en colon derecho y asociado con un pronóstico favorable; Nuevos drivers posibles: ARlD1A, SOX9, FAM123B/WTX; Sobreexpresión de: ERBB2, IGF2; mutaciones en la vía de WNT[17]
Adenocarcinoma de estómago 443 X Identificado cuatro subytpes: EBV caracterizada por infección del virus de Epstein-Bar, MSI (inestabilidad de microsatélites) caracterizado por hipermutación, GS caracterizado por estabilidad genómica, CIN caracterizado por inestabilidad cromosómica; CIN enriquecida para las mutaciones en tirosina quinasas[18]
Carcinoma del esófago 185 X
Cystadenocarcinoma seroso ovárico 586 X Mutaciones en TP53 se produjeron en el 96% de los casos estudiados;[19] Las mutaciones en BRCA1 y BRCA2 se produjeron en el 21% de los casos y se asocia con resultados más favorables[20]
Carcinoma endometrio cuerpo uterino 548 X Cánceres de endometrio clasificados en cuatro categorías: POLO ultramutated, hypermutated MSI (inestabilidad de microsatélites), número de copias alta baja, número de copias; Los carcinomas serosos uterinos tienen similares perfiles genómicos ovárico serosos y basales como carcinomas del pecho y menos pronósticos favorables que uterina endometriod carcniomas[21]
Cervical de células escamosas y Adenocarcinoma 308 X
Cabeza y cuello de células escamosas 528 X Identificaron características genómicas de VPH relacionados con y fumar cánceres relacionados con: VPH positivo caracterizado por acortado o eliminado TRAF3, HPV negativo caracterizado por la amplificación conjunta de 11q13 y 11q22, fumar relacionados caracterizado por TP53 mutaciones, CDKN2A inactivación, alteraciones de número de copia[22]
Carcinoma de la tiroides 507 X Mayoría por mutaciones RAS o BRAFV600E; tumores por estas mutaciones son distintos[23]
Leucemia mieloide aguda 200 X Tumores AML contienen muy pocas mutaciones en comparación con otros tipos de cáncer, sólo 13 mutaciones de la codificación en promedio por tumor; Eventos de controlador clasificados en nueve categorías, incluyendo fusiones de factor de transcripción, las mutaciones modificadoras de histonas, espliceosoma mutaciones y otros
Melanoma cutáneo 470 X Establecido cuatro subtipos de melanoma cutáneo, BRAF mutante, RAS mutante, MFR mutante y tipo salvaje Triple basada en mutaciones del conductor; Mayores niveles de infiltración de linfocitos inmunes correlacionado con mejor supervivencia de los pacientes
Adenocarcinoma de pulmón 521 X Adenocarcinomas de pulmón contienen un promedio muy alto de mutaciones; 76 por ciento de los tumores del adenocarcinoma de pulmón estudiadas demostraron activación de vías de cinasa de tirosina del receptor[24]
Carcinoma de células escamosas de pulmón 504 X Carcinomas de células escamosas de pulmón contienen un alto promedio de mutaciones y aberraciones de número de copia; como Cystadenocarcinoma seroso ovárico casi todos tumores de Carcinoma de células escamosas de pulmón estudiados contienen una mutación en TP53; Muchos tumores contienen mutaciones que hacen inactivo en HLA-A puede evitar el cáncer detección inmune[25]
Carcinoma de células claras 536 X Comúnmente mutados genes incluidos BVS implicados en la detección de oxígeno, SED2 involucrados en la modificación epigenética que hypomethylation global y los genes de la vía PI3K/AKT/mTOR; Cambio metabólico similar al efecto de Warburg se correlaciona con un pronóstico pobre[26]
Carcinoma papilar de riñón 291 X
Cáncer de vejiga invasivo urotelial 412 X Fumar se asocia con riesgo de Carcinoma urotelial de la vejiga; Frecuentemente mutados genes incluidos TP53 que se inactivó en 76% de los tumores estudiados, ERBB2 (HER2), genes en el receptor tirosina quinasa (RTK) / vías RAS alteración en 44 por ciento;[27]
Adenocarcinoma de próstata 498 X
Carcinoma de células renales cromófobo 66 X Carcinoma de células renales cromófobo tiene una baja tasa de mutación en comparación con la mayoría de los cánceres incluyendo el Carcinoma de células claras; Carcinoma de células renales cromófobo origina de las regiones más distales del riñón en comparación con el Carcinoma de células claras que proviene principalmente de las regiones proximales; Cambio metabólico en el Carcinoma Renal cromófobo es distinta de lo Warburg efecto-como cambio observado en el Carcinoma de células claras; TP53 y PTEN genes supresores de tumores se transformó con frecuencia; TERC promotor del gen fue alterado con frecuencia[28]
Carcinoma adrenocortical 80 X
Paraganglioma y feocromocitoma 179 X
Colangiocarcinoma 36 X
Carcinoma Hepatocelular hígado 377 X
Adenocarcinoma Ductal pancreática 185 X
Carcinosarcoma uterino 57 X
Melanoma Uveal 80 X
Thymoma 124 X
Sarcoma de 261 X
Mesotelioma 87 X
Cáncer testicular de células germinales 150 X

Multiforme de glioblastoma

En 2008, el TCGA publicó sus primeros resultados en Multiforme de glioblastoma (GBM) en Naturaleza.[29] Estos primeros resultados publican en 91 pares coincidentes de tumor normal. Mientras que 587 hay fueron recogidos para el estudio, la mayoría fueron rechazada durante el control de calidad: las muestras de tumor no mayor de 50% necrosis y una evaluación de la patología secundaria que concuerdan en que el diagnóstico original de GBM era preciso y necesarias para contener los núcleos del tumor por lo menos 80%. Un último lote de muestras fueron excluidos porque el DNA o RNA recogido no era de suficiente calidad o cantidad para ser analizadas por todas las diferentes plataformas utilizadas en este estudio.

Todos los datos del papel, así como los datos que se han recogido desde la publicación están disponibles al público en el centro de coordinación de datos (DCC) para el acceso público.[30] La mayoría de los datos TCGA es completamente libre acceso, excepto los datos que potencialmente podrían identificar a pacientes específicos. Este clínico controlado-acceso a los datos pueden accederse a través de solicitud al Comité de acceso de datos (DAC), que evalúa si el usuario final es un investigador bona fide y pide una pregunta científica legítima que merece el acceso a los datos de nivel individual.[31] Este proceso es similar a la de otros programas financiados por el NIH, incluyendo dbGAP.

Desde la publicación del primer libro de marcador, varios grupos de análisis dentro de la red del TCGA presentan análisis más detallado de la glioblastoma datos. Un grupo de análisis dirigido por Roel Verhaak, PhD, Katie Hoadley, PhD y Neil Hayes, MD, correlacionados con éxito glioma de subtipos de expresión génica con anormalidades genomic.[32] El Metilación del ADN equipo de análisis de datos, dirigido por Noushmehr Houtan, PhD y Peter Laird, PhD, identificó un subconjunto distinto de glioma de muestras que muestra concertada hipermetilación en un gran número de loci, indicando la existencia de un glioma-Fenotipo de methylator de isla de CpG (G-CIMP). G-CIMP tumores pertenecen al subgrupo proneurales y estaban fuertemente asociados con IDH1 mutaciones somáticas.[33][34]

Seroso ovárico

A partir de una nueva era en la secuenciación del genoma del cáncer, TCGA informó sobre la secuenciación del exoma de 316 muestras tumorales de cáncer de ovario seroso de alto grado en Naturaleza en junio de 2011.[35]

Carcinoma colorrectal

TCGA informó sobre la secuenciación del exoma y análisis de expresión génica de 276 muestras de tumor de colon y cáncer rectal, incluyendo la secuenciación del genoma entero de 97 muestras, en Naturaleza en julio de 2012.[36] Recientemente, una base de datos conocido como Atlas de cáncer colorrectal (https://colonatlas.org) integración de la genómica y proteómica datos referentes a los tejidos de cáncer colorrectal de líneas TCGA y celular se ha desarrollado.

Estado a partir de 2013: paisaje mutacional de subtipos de cáncer común 12

En 2013, TCGA publicó una descripción del "paisaje mutacional" definida con frecuencia mutaciones recurrentes identificados de secuenciación de genoma completo de 3.281 genomas del cáncer del 12 que ocurren comúnmente subtipos de cáncer. Los doce subtipos estudiados fueron adenocarcinoma de mama, adenocarcinoma de pulmón, carcinoma de células escamosas de pulmón, carcinoma endometrial, multiforme de glioblastoma, carcinoma de células escamosas de la cabeza y el cuello, cáncer de colon, cáncer rectal, cáncer de vejiga, riñón carcinoma de células claras, carcinoma de ovario y leucemia mieloide aguda.[37]

Véase también

  • Proyecto del genoma del cáncer en el Wellcome Trust Sanger Institute
  • Consorcio del genoma de cáncer internacional
  • Lista de bases de datos biológicas

Referencias

  1. ^ "La página de inicio de Cancer genoma Atlas". NCI y de la NHGRI. 2009-04-28. 
  2. ^ NIH lanza el proyecto del genoma del cáncer Washington Post 14 de diciembre de 2005
  3. ^ Daniela S. Gerhard (2008-05-27). "TCGA avanzando Oncología Molecular". Cáncer NCI boletín, actualización del Director. Instituto Nacional del cáncer. 2009-08-27. 
  4. ^ "Los cánceres seleccionados para estudio". El Atlas de genoma del cáncer - National Cancer Institute. 2015-11-02. 
  5. ^ "Proyectos de caracterización del Tumor raro". El Atlas de genoma del cáncer - National Cancer Institute. 2015-11-02. 
  6. ^ McLendon, R.; Friedman, Allan; Bigner, Darrell; Van Meir, Erwin G.; Brat, Daniel J.; M. Mastrogianakis, Gena; Olson, Jeffrey J.; Mikkelsen, Tom; et al (2008-10-23). "Caracterización genómica completa define glioblastoma humano genes y vías centrales". Naturaleza. 455 (7216): 1061-1068. doi:10.1038/nature07385. PMC 2671642Freely accessible. PMID 18772890. 
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Acoplamientos externos

  • El Atlas del genoma de cáncer
  • Oficina NCI de la genómica del cáncer
  • Centro de genómica del cáncer en UC Santa Cruz
  • Iniciativa de anotación genética de CGAP
  • Wiki NCI
  • Atlas de cáncer colorrectal

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